Usianya baru menginjak remaja "seventen", masa transisi dari anak-anak menuju dewasa yang ditandai dengan banyak perubahan. Saat memasuki masa remaja, tentu akan mengalami masa pubertas fase pertumbuhan di mana akhirnya mengalami ataupun mencapai kematangan reproduksinya. begitulah kiranya analogi dari MTs USB menuju MTsN 3 Batam.
Perjalanan panjang yang berliku dan tidak mudah, penuh pengharapan, banyak pengorbanan waktu, tenaga, fikiran dalam memperjuangkan alih nama dan alih status madrasah. Dengan banyaknya capaian prestasi yang telah diraih, baik di bidang akdemik, non akademik, serta tingginya kepercayaan masyarakat dengan madrasah ini, terbukti setiap penerimaan siswa baru dari tahun ke tahun siswa-siswinya terus mengalami kenaikan, rasanya sudah sangat pantas madrasah ini bergerak menuju MTsN 3 Batam. Telah lama menyandang status "filial" kelas jauhnya MTsN 1 Batam. Meskipun berdiri pada tahun 2007, namun perjuangan bermula di tahun 2010. Dari kepala madrasah yang satu berlanjut ke kepala madrasah berikutnya. Semangat itu tidak pernah berubah dalam memperjuangkan alih nama dan alih status. Dari tahun ke tahun kita menunggu dengan harapan dan doa yang tidak pernah putus. Dibawah kepemimpinan bapak Eka Nopri Yandri, S.Pd, perjuangan itu semakin intens dan masif dan upaya jemput bola terus di gesa. Lebih dari satu dekade perjuangan itu akhirnya berbuah manis, doa dan harapan itu akhirnya terjawab, pucuk dicinta ulam pun tiba. Tepatnya Kamis, 26 september 2024 Bapak H. Subadi (Kabid) Madrasah Kanwil Kemenag Kepri dan Bapak Eka Nopri Yandri, S.Pd (Kamad) MTs USB Filial MTsN 1 Batam. Menerima dan menjemput Piagam Penegerian MTs Negeri 3 Kota Batam yang diserahkan oleh Direktur Pendidikan Islam Kemenag RI Bapak Abu Rokhmad, di Jakarta. Berlanjut hari senin, 30 September 2024 Bapak Eka Nopri Yandri, S.Pd. Di lapangan utama madrasah dan di ruangan majelis ia menyampaikan kabar bahagia ini, kepada seluruh warga madrasah (Guru, karyawan serta siswa-siswi). Dalam penyampaiannya, kita patut bersyukur dan berbahagia dengan perubahan nama dan status madrasah kita, kabarkan berita baik ini dengan berbagai prestasi sehingga MTsN 3 Batam semakin dikenal, dan terimakasih juga kepada semua pihak yang telah ikut serta dan berperan dalam penegerian ini. Selanjutnya terkait administrasi dan detail lainnya sambil berjalan dan kita masih menunggu terbitnya Peraturan Menteri Agama (PMA). Semua harap bersabar dan mohon doanya segera rampung sebelum akhir tahun ini, tutupnya".Terhitung mulai tanggal 1 Oktober 2024 MTs USB Filial MTsN 1 Batam berganti nama dan status menjadi MTs Negeri 3 Kota Batam. (SN)